到这季开始时,X档案已是家喻户晓的科幻影集了。虽然仍被某些人认为太过偏激,但在金球奖艾美奖纷纷获得肯定。今年仍是一贯过去的风格,但加入了许多穆德、史卡利个别的个人生活。穆德的另一资料来源-X在今年死亡。另外一重大发展则是史卡利发现自己患有癌症,住院治疗,病情虽稳定住,但仍有危险。本季也介绍了癌人的年轻时代,向观众交待他的历史。本季也包括了一集喜剧,相信看过的朋友都知道。本季结束于穆德在从阿拉斯加调查回来后对生命厌倦,而举枪自杀。